Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LSAMPQ13449 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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