Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE3BQ13370 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE3BQ13370 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
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