Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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SKP2Q13309 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKP2Q13309 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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