Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SRSF6Q13247 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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