Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ERCC8Q13216 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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ERCC8Q13216 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERCC8Q13216 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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