Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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TRAF1Q13077 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAF1Q13077 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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TRAF1Q13077 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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TRAF1Q13077 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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TRAF1Q13077 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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TRAF1Q13077 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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TRAF1Q13077 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAF1Q13077 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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