Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRDM2Q13029 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
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