Protein–RNA interactions for Protein: Q12893

TMEM115, Transmembrane protein 115, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM115Q12893 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM115Q12893 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms