Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CGNL1Q0VF96 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms