Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF4Q08170 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms