Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP1-1Q07627 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms