Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
UBE3AQ05086 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UBE3AQ05086 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms