Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KCNC4Q03721 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms