Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APBA1Q02410 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms