Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
OTUD4Q01804 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OTUD4Q01804 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms