Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DEFA6Q01524 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DEFA6Q01524 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms