Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRF9Q00978 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms