Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMAD3P84022 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMAD3P84022 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms