Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRB1P82279 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRB1P82279 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRB1P82279 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRB1P82279 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CRB1P82279 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CRB1P82279 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRB1P82279 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CRB1P82279 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRB1P82279 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRB1P82279 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRB1P82279 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRB1P82279 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRB1P82279 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRB1P82279 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRB1P82279 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms