Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP2P81877 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms