Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PHC1P78364 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PHC1P78364 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHC1P78364 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms