Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2IP78347 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms