Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CSNK2A1P68400 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSNK2A1P68400 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms