Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ACTA1P68133 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ACTA1P68133 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms