Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ACTG1P63261 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms