Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO4P61968 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO4P61968 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO4P61968 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO4P61968 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO4P61968 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO4P61968 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO4P61968 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LMO4P61968 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms