Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GABARAPL2P60520 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms