Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ERVFRD-1P60508 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms