Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RHBDL3P58872 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDL3P58872 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms