Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP107P57740 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP107P57740 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP107P57740 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NUP107P57740 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NUP107P57740 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms