Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPK4P57078 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RIPK4P57078 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms