Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CTBP2P56545 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTBP2P56545 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms