Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SH3BGRP55822 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms