Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ELLP55199 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ELLP55199 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ELLP55199 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ELLP55199 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms