Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D1P54289 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNA2D1P54289 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms