Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFNA3P52797 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
EFNA3P52797 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms