Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEK4P51957 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK4P51957 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK4P51957 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK4P51957 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEK4P51957 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK4P51957 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms