Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRE11P49959 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRE11P49959 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRE11P49959 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MRE11P49959 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRE11P49959 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRE11P49959 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRE11P49959 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRE11P49959 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MRE11P49959 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms