Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPAP49450 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPAP49450 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPAP49450 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms