Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AMPHP49418 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMPHP49418 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMPHP49418 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMPHP49418 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms