Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC11A1P49279 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC11A1P49279 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms