Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MCAMP43121 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCAMP43121 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCAMP43121 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCAMP43121 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCAMP43121 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MCAMP43121 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MCAMP43121 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCAMP43121 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCAMP43121 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCAMP43121 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCAMP43121 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms