Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5CP41229 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KDM5CP41229 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms