Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL1P40616 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL1P40616 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL1P40616 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL1P40616 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL1P40616 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ARL1P40616 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ARL1P40616 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARL1P40616 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms