Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK1P39086 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms