Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP6P35125 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP6P35125 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP6P35125 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP6P35125 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP6P35125 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP6P35125 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP6P35125 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP6P35125 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP6P35125 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP6P35125 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP6P35125 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP6P35125 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP6P35125 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms