Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXA7P31268 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms