Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP1P30622 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP1P30622 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms