Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPOP30536 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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