Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCND2P30279 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCND2P30279 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCND2P30279 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCND2P30279 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCND2P30279 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCND2P30279 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCND2P30279 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCND2P30279 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCND2P30279 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCND2P30279 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms